NVIDIA, Evozyne Proteinler İçin Yapay Zeka Modeli Oluşturuyor

NVIDIA, Evozyne Proteinler İçin Yapay Zeka Modeli Oluşturuyor


NVIDIA’nın önceden eğitilmiş bir yapay zeka modelini kullanan startup Evozyne, sağlık hizmetleri ve temiz enerjide önemli potansiyele sahip iki protein yarattı.

Bugün yayınlanan ortak bir belge, süreci ve ürettiği biyolojik yapı taşlarını anlatıyor. Biri doğuştan gelen bir hastalığı tedavi etmeyi amaçlar, diğeri ise küresel ısınmayı azaltmak için karbondioksit tüketmek üzere tasarlanmıştır.

İlk sonuçlar, ilaç keşfini hızlandırmanın yeni bir yolunu ve daha fazlasını gösteriyor.

Evozyne’nin kurucu ortağı ve makalenin ortak yazarı Andrew Ferguson, “Yapay zeka modelinin bu ilk turda bile doğal olarak oluşanlar kadar iyi sentetik proteinler üretmesi gerçekten cesaret verici” dedi. “Bu bize doğanın tasarım kurallarını doğru öğrendiğini söylüyor.”

Dönüşümsel Bir Yapay Zeka Modeli

Evozyne, NVIDIA’nın bir parçası olan bir transformatör modeli olan ProtT5 uygulamasını kullandı. NVIDIA BioNeMosağlık hizmetleri için yapay zeka modelleri oluşturmaya yönelik bir yazılım çerçevesi ve hizmeti.

Kimya ve makine öğreniminin kesişme noktasında çalışan bir moleküler mühendis olan Ferguson, “BioNeMo bize gerçekten model eğitimini desteklemek ve ardından modelle işleri çok ucuza yürütmek için ihtiyacımız olan her şeyi verdi – sadece birkaç saniye içinde milyonlarca dizi oluşturabiliyorduk” dedi. .

Model, Evovyne’nin ProT-VAE adlı sürecinin merkezinde yer alır. BioNeMo’yu filtre görevi gören değişken otomatik kodlayıcı ile birleştiren bir iş akışıdır.

“Protein tasarlamak için varyasyonel otomatik kodlayıcılarla birleştirilmiş büyük dil modellerini kullanmak, sadece birkaç yıl önce kimsenin radarında değildi” dedi.

Model Doğanın Yöntemlerini Öğrenir

Kitap okuyan bir öğrenci gibi, NVIDIA’nın dönüştürücü modeli milyonlarca proteindeki amino asit dizilerini okur. Sinir ağlarının metni anlamak için kullandığı teknikleri kullanarak, doğanın biyolojinin bu güçlü yapı taşlarını nasıl bir araya getirdiğini öğrendi.

Model daha sonra Evozyne’nin ele almak istediği işlevlere uygun yeni proteinlerin nasıl bir araya getirileceğini tahmin etti.

“Teknoloji, 10 yıl önce boş hayaller olan şeyleri yapmamızı sağlıyor” dedi.

Olasılıklar Denizi

Makine öğrenimi, astronomik sayıdaki olası protein dizilerinde gezinmeye yardımcı olur ve ardından en yararlı olanları verimli bir şekilde tanımlar.

Yönlendirilmiş evrim adı verilen geleneksel protein mühendisliği yöntemi, yavaş, vur ya da ıskala yaklaşımı kullanır. Tipik olarak bir seferde yalnızca birkaç amino asidi sırayla değiştirir.

Evozyne'nin ProT-VAE iş akışı, NVIDIA BioNeMo ile yararlı proteinler üretir
Evozyne’nin ProT-VAE süreci, ilaç keşfi ve enerji sürdürülebilirliği için faydalı proteinler üretmek üzere NVIDIA BioNeMo’da güçlü bir transformatör modeli kullanır.

Aksine, Evozyne’nin yaklaşımı, bir proteindeki amino asitlerin yarısını veya daha fazlasını tek bir turda değiştirebilir. Bu, yüzlerce mutasyon yapmaya eşdeğerdir.

“Yeni ve yararlı işlevlere sahip, daha önce hiç görülmemiş proteinleri keşfetmemizi sağlayan büyük sıçramalar yapıyoruz” dedi.

Yeni süreci kullanan Evozyne, hastalıklar ve iklim değişikliği ile mücadele etmek için bir dizi protein oluşturmayı planlıyor.

Eğitim Süresini Azaltmak, Modelleri Ölçeklendirmek

“NVIDIA bu işte inanılmaz bir ortak oldu” dedi.

Evozyne’de bir veri bilimcisi olan Joshua Moller, “Eğitimi hızlandırmak için işleri birden çok GPU’ya göre ölçeklendirdiler” dedi. “Her dakika tüm veri kümelerini inceliyorduk.”

Bu, büyük yapay zeka modellerini eğitme süresini aylardan bir haftaya indirdi. Ferguson, “Bazıları milyarlarca eğitilebilir parametreye sahip modelleri eğitmemize izin verdi, bu başka türlü mümkün olmayacaktı,” dedi.

Gelecek Çok Daha Fazlası

AI ile hızlandırılmış protein mühendisliğinin ufku geniştir.

Difüzyon modellerinin son zamanlardaki yükselişine dikkat çekerek, “Alan inanılmaz derecede hızlı hareket ediyor ve bundan sonra ne olacağını görmek beni gerçekten heyecanlandırıyor” dedi.

“Beş yıl sonra nerede olacağımızı kim bilebilir?”

Erken erişim için kaydolun NVIDIA BioNeMo uygulamalarınızı nasıl hızlandırabileceğini görmek için.


Kaynak : https://blogs.nvidia.com/blog/2023/01/12/generative-ai-proteins-evozyne/

Bir cevap yazın

E-posta hesabınız yayımlanmayacak. Gerekli alanlar * ile işaretlenmişlerdir

SMM Panel PDF Kitap indir